日本水稻(Oryza sativa Japonica rice)的基因组染色质长度 IRGSP-1.0

创作日志: 在看scHi-C综述的时候发现了一个在2021年发布在Nature Plants上的数据集,想拿来用,首先就要知道其对应的水稻品种以及染色质长度。最终在UCSC上找到了对应的组装好的基因组,版本名为 IRGSP-1.0。


UCSC链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/genome/GCF_001433935.1/
chr1	43270923
chr2	35937250
chr3	36413819
chr4	35502694
chr5	29958434
chr6	31248787
chr7	29697621
chr8	28443022
chr9	23012720
chr10	23207287	
chr11	29021106	
chr12	27531856	

染色质长度在这里看:

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